1、遵守的管理制度不同
公务员接受《中华人民共和国公务员法》的管理和监督，事业单位服从《事业单位人事管理条例》的管理。前者是法律，后者是行政法规，管理层级不一样，法律高于行政法规。
2、编制不同
体制内有两种编制，公务员使用行政编制，事业单位使用事业编制，行政编制人员较少，事业编制人员较多。相对来说，行政编制比较紧缺，编制控制得也特别严格。因此，公务员招聘数量比事业单位招聘要少，选拔更为严格，上岸也更加困难。
3、晋升空间不同
在个人发展上公务员走的是行政职务路线，比如：副科长、科长、副处长，处长；事业单位除少数管理人员外，大多数走的是专业技术职务路线，比如：初级职称、中级职称，副高职称、正高职称。相比较而言，公务员的职务晋升受外部因素制约更多，事业单位走专业技术路线，个人因素影响更大。
4、福利待遇不同
公务员走的是职务和级别工资，事业人员走的是职称工资。相对来说，晋升职称要比职务提拔、职级晋升要容易一些，只要有业务专长、工作成绩，评上职称、涨工资不算难，很多事业人员工资要超过公务员。
